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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Unidades Centrais. |
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Data corrente: |
13/07/2022 |
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Data da última atualização: |
29/01/2024 |
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Autoria: |
SÁ, L. G. de; AZEVEDO, A. M.; ALBUQUERQUE, C. J. B.; VALADARES, N. R.; BRITO, O. G.; FERNANDES, A. C. G.; ASPIAZÚ, I. |
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Afiliação: |
LUDIMILA GEICIANE DE SÁ, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; ALCINEI MISTICO AZEVEDO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; CARLOS JULIANO BRANT ALBUQUERQUE, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; NERMY RIBEIRO VALADARES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; ORLANDO GONÇALVES BRITO, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; ANA CLARA GONÇALVES FERNANDES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE MINAS GERAIS; IGNACIO ASPIAZÚ, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MONTES CLAROS. |
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Título: |
Kohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes. |
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Ano de publicação: |
2022 |
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Fonte/Imprenta: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02722, 2022. |
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DOI: |
https://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2022.v57.02722 |
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Idioma: |
Inglês |
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Notas: |
Título em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. |
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Conteúdo: |
ABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômicos de cultivares e genótipos de soja. Para análise dos dados, utilizaram-se redes neurais artificiais do tipo SOM. O método proposto permitiu a determinação da melhor arquitetura de rede de forma não subjetiva. Além disso, no início do treinamento, foi possível mitigar o efeito da aleatoriedade dos pesos sinápticos sobre os grupos formados. Foram formados seis grupos dissimilares; portanto, há dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. As cultivares C25, C8 e C13 podem ser combinadas com as C36, C31, C32 e C33, por apresentarem bons atributos de produtividade e alta dissimilaridade. A metodologia proposta é vantajosa em comparação ao uso de SOMs tradicionais e se mostrou eficiente devido à consistência dos agrupamentos de acordo com a análise discriminante de Anderson. MenosABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômico... Mostrar Tudo |
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Thesagro: |
Genótipo; Glycine Max; Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genética; Soja; Variedade. |
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Thesaurus Nal: |
Cultivars; Genotype; Multivariate analysis; Plant breeding; Soybeans. |
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Categoria do assunto: |
-- |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/doc/1144702/1/Kohonens-self-organizing-maps-2022.pdf
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Marc: |
LEADER 03489naa a2200349 a 4500
001 2144702
005 2024-01-29
008 2022 bl uuuu u00u1 u #d
024 7 $ahttps://doi.org/10.1590/S1678-3921.pab2022.v57.02722$2DOI
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245 $aKohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes.$h[electronic resource]
260 $c2022
500 $aTítulo em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja.
520 $aABSTRACT - The objective of this work was to evaluate the genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes for the selection of parents, as well as to propose a new method for using Kohonen?s self-organizing maps (SOMs) and to test its efficiency through Anderson?s discriminant analysis. The morphoagronomic descriptors of soybean cultivars and genotypes were evaluated. For data analysis, SOM-type artificial neural networks were used. The proposed method allowed the determination of the best network architecture in a nonsubjective way. Furthermore, at the beginning of training, it was possible to mitigate the randomness effect of the synaptic weights on the formed clusters. Six dissimilar clusters were formed; therefore, there is genetic dissimilarity between soybean cultivars and genotypes. Cultivars C25, C8, and C13 can be combined with C36, C31, C32, and C33 because they show good yield-related attributes and high dissimilarity. The proposed methodology is advantageous in comparison with the use of traditional SOMs, besides being efficient due to clustering consistency according to Anderson?s discriminant analysis. RESUMO - O objetivo deste trabalho foi avaliar a dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja para a seleção de genitores, bem como propor um novo método para a utilização de mapas auto-organizáveis de Kohonen (SOMs) e testar sua eficiência por meio da análise discriminante de Anderson. Foram avaliados os descritores morfoagronômicos de cultivares e genótipos de soja. Para análise dos dados, utilizaram-se redes neurais artificiais do tipo SOM. O método proposto permitiu a determinação da melhor arquitetura de rede de forma não subjetiva. Além disso, no início do treinamento, foi possível mitigar o efeito da aleatoriedade dos pesos sinápticos sobre os grupos formados. Foram formados seis grupos dissimilares; portanto, há dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja. As cultivares C25, C8 e C13 podem ser combinadas com as C36, C31, C32 e C33, por apresentarem bons atributos de produtividade e alta dissimilaridade. A metodologia proposta é vantajosa em comparação ao uso de SOMs tradicionais e se mostrou eficiente devido à consistência dos agrupamentos de acordo com a análise discriminante de Anderson.
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700 1 $aASPIAZÚ, I.
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Registro original: |
Embrapa Unidades Centrais (AI-SEDE) |
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| 1. |  | TAULA, A. J. V.; ANDRADE JÚNIOR, V. C. de; RESENDE, F. V.; BRITO, O. G.; SILVA, J. C. de O.; PERREIRA, A. G. Agronomic performance, flowering, physicochemical characteristics and genetic divergence in garlic accessions from Brazil. Australian Journal of Crop Science, v. 15, n. 12, p. 1372-1380, Dec. 2021.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 2. | | CARVALHO, A. J. de; SOUZA, V. B. de; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; PEREIRA FILHO, I. A.; BATISTA, P. S. C.; BRITO, O. G. Adaptabilidade e estabilidade produtiva de linhagens elite e cultivares de feijão-caupi de porte prostrado em ambientes de Mato Grosso e Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 131. Na publicação: KAESEL JACKSON DAMASCENO-SILVA| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 3. | | CARVALHO, A. J. de; SOUZA, V. B. de; SILVA, K. J. D.; ROCHA, M. de M.; PEREIRA FILHO, I. A.; BATISTA, P. S. C.; BRITO, O. G. Adaptabilidade e estabilidade produtiva de linhagens elite e cultivares de feijão-caupi de porte prostrado em ambientes de Mato Grosso e Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 131.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 4. | | SOUZA, V. B. de; CARVALHO, A. J. de; SILVA, K. J. D.; ROCHA, M. de M.; PEREIRA FILHO, I. A.; BRITO, O. G.; SILVA, M. B. de O. Adaptabilidade e estabilidade produtiva de linhagens-elite e cultivares de feijão-caupi de portes ereto e semiereto em ambientes de Mato Grosso e Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 132.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 5. | | OLIVEIRA, M. B. de; BRITO, O. G. de; SOUZA, V. B. de; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; CARVALHO, A. J. de. Arquitetura e valor de cultivo de linhagens de feijão-caupi de porte ereto e semi-ereto, no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/113c.pdf. Acesso em: 09 jul. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 6. | | SOUZA, V. B. de; CARVALHO, A. J. de; BRITO, O. G.; SILVA, M. B. de O.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D.; PEREIRA FILHO, I. A. Comprimento de vagem e índice de grãos de genótipos de feijão-caupi de porte semiprostrado em ambientes de Mato Grosso e Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 154.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 7. | | GAMA, A. B. N. DA; SILVA, E. A. DA; ANDRADE JÚINIOR, V. C. DE; BRITO, O. G.; COSTA, A. L. DA; CAVASIN, P. Y.; CARVALHO, E. E. N. Potential use of sweet potato leaves for human consumption. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 58, e02991, 2023. Título em português: Uso potencial de folhas de batata doce para consumo humano.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 8. | | SOUZA, V. B. de; CARVALHO, A. J. de; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; PEREIRA FILHO, I. A.; OLIVEIRA, S. M. de; BRITO, O. G. Grau de acamamento de linhagens-elite de feijão-caupi de porte ereto em ambientes de Minas Gerais e Mato Grosso. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercados: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 80. Na publicação: Kaesel Jackson Damasceno-Silva.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte; Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 9. | | CARVALHO, A. J. de; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; BRITO, O. G.; OLIVEIRA, M. B. de; SOUZA, A. A. de. Grau de acamamento e tipo de porte de linhagens de feijão-caupi do grupo ereto e semi-ereto, no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/138c.pdf. Acesso em: 23 jul. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 10. | | CARVALHO, A. J. de; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; SOUZA, V. B. de; OLIVEIRA, M. B. de; BRITO, O. G. de. Grau de acamamento e tipo de porte de linhagens de feijão-caupi do grupo prostrado e semi-prostrado, no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/138b.pdf. Acesso em: 23 jul. 2013.| Tipo: Artigo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 11. | | SÁ, L. G. de; AZEVEDO, A. M.; ALBUQUERQUE, C. J. B.; VALADARES, N. R.; BRITO, O. G.; FERNANDES, A. C. G.; ASPIAZÚ, I. Kohonen's self-organizing maps for the study of genetic dissimilarity among soybean cultivars and genotypes. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02722, 2022. Título em português: Mapas auto-organizáveis de Kohonen no estudo da dissimilaridade genética entre cultivares e genótipos de soja.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 12. | | OLIVEIRA, M. E. F. de; ANDRADE JUNIOR, V. C. de; BRITO, O. G.; AZEVEDO, S. M.; SILVA, J. C. de O.; SILVA, E. A. da; AZEVEDO, A. M. Repeatability coefficient for the determination of the optimal number of harvests for the selection of zucchini hybrids. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e03016, 2022. Título em português: Coeficiente de repetibilidade para a determinação do número ótimo de colheitas para seleção de abobrinha-italiana.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 13. | | BRITO, O. G.; TAULA, A. J. V.; ANDRADE JUNIOR, V. C. de; RESENDE, F. V.; PEREIRA, A. G.; SILVA, C. de O.; COSTA, A. L. da. Produtividade e capacidade de florescimento de acessos experimentais de alho. In: CONGRESSO DA PÓS-GRADUAÇÃO DA UFLA, 28., 2019, Lavras. Importância da internacionalização no desenvolvimento das universidades brasileiras. Anais [...]. Lavras: Pró Reitoria de Pós Graduação, 2019. p. 1832-1833 Resumo.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças. |
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| 14. | | SOUZA, V. B. de; CARVALHO, A. J. de; SILVA, K. J. D. e; ROCHA, M. de M.; PEREIRA FILHO, I. A.; BRITO, O. G.; SILVA, M. B. de O. Adaptabilidade e estabilidade produtiva de linhagens-elite e cultivares de feijão-caupi de portes ereto e semiereto em ambientes de Mato Grosso e Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 132. Na publicação: KAESEL JACKSON DAMASCENO-SILVA| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 15. | | SANTOS, M. A. V.; ANDRADE JÚNIOR, V. C. de; GUIMARÃES, A. G.; BRITO, O. G.; TAULA, A. J. V.; COSTA, R. A.; ALVES, J. P. R.; SILVA, N. O.; RESENDE, F. V. Correlations between agronomic characters in garlic. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 57, e02603, 2022. Título em português: Correlações entre características agronômicas em alho.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Hortaliças; Embrapa Unidades Centrais. |
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| 16. | | SOUZA, V. B. de; CARVALHO, A. J. de; BRITO, O. G.; SILVA, M. B. de O.; ROCHA, M. de M.; SILVA, K. J. D. e; PEREIRA FILHO, I. A. Comprimento de vagem e índice de grãos de genótipos de feijão-caupi de porte semiprostrado em ambientes de Mato Grosso e Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 4., 2016, Sorriso. Feijão-caupi: avanços e desafios tecnológicos e de mercado: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2016. p. 154. KAESEL JACKSON DAMASCENO-SILVA| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Meio-Norte. |
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| 17. | | CARVALHO, A. J. de; SOUZA, T. L. P. O. de; CARNEIRO, J. E. de S.; ABREU, A. de F. B.; SILVA, M. B. de O.; BRITO, O. G.; SOUZA, A. A. de. Desempenho de linhagens-elite de feijão ?carioca? de dois ciclos avaliação, no norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 86. CONAFE| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 18. | | SILVA, F. G. da; ASPIAZÚ, I.; OLIVEIRA, R. M. de; SILVA, K. M. de J.; SANTOS, S. R. dos; PORTUGAL, A. F.; MOREIRA, J. A. A.; BRITO, O. G.; SILVA, N. P. da. Tensão de água no solo para o reinício da irrigação de milho verde no semiárido. Revista Brasileira de Milho e Sorgo, Sete Lagoas, v. 17, n. 2, p. 190-200, 2018.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 2 |
| Biblioteca(s): Embrapa Milho e Sorgo. |
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| 19. | | CARVALHO, A. J. de; SOUZA, T. L. P. O. de; CARNEIRO, J. E. de S.; ABREU, A. de F. B.; SILVA, M. B. DE O.; BRITO, O. G.; MEDEIROS, J. C.; SILVA, R. F. Valor agronômico de linhagens-elite de feijão de ?grãos especiais? de dois ciclos de avaliação, no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 131. CONAFE| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Arroz e Feijão. |
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| 20. | | CARVALHO, A. J. de; SOUZA, T. L. P. O.; CARNEIRO, J. E. de S.; ABREU, A. de F. B.; SILVA, M. B. de O.; BRITO, O. G.; MEDEIROS, J. C.; SOUZA, A. S. A. Valor agronômico de linhagens-elite de feijão ?preto? de dois ciclos de ensaios de VCU conduzidos no Norte de Minas Gerais. In: CONGRESSO NACIONAL DE PESQUISA DE FEIJÃO, 12., 2017, Piracicaba. Produtividade e sustentabilidade da cultura do feijão: do campo para a mesa: resumos. Piracicaba: CENA: IAC, 2017. p. 130. CONAFE| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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